医療用ソフト LD1

LAMP用デザイン共有

ホモロジーとテンプレート構造の自動回避 ローカルおよびデスクトップBLASTオプション 自動配列検索 配列表示 プライマー計算機 データ＆データベース管理 レポート作成 LAMP Designerについて OptiGene社は、Loop-Mediated Isothermal Amplification（LAMP）アッセイ用の効率的なプライマーを設計するためのソフトウェアアプリケーションを提供しています。LAMPは、日本の栄研化学株式会社によって発明された等温DNA増幅法で、わずか30分で数コピーのDNAを109コピーまで増幅することができます。 逆転写とLAMPを組み合わせることで、RNA配列の増幅にも応用できる。LAMP法は、ターゲットDNAの8つの領域を認識する6つの特別に設計されたプライマーを使用し、この6つのプライマーの設計がアッセイを成功させるために重要である。 LAMP Designerは、GenBankなどのオンラインソースから遺伝子配列のバッチを直接プログラムに取り込みます。このアプリケーションは、プライマー設計中にクロスホモロジーを避けるためにBLAST検索を実行することができます。また、カスタムデータベースや未公開データベースを使用するためのローカルおよびデスクトップBLASTオプションもサポートしています。 LAMP Designerには、配列上にプライマーがマークされた配列ビューが組み込まれており、最近傍熱力学理論と高精度のSantaLucia値を使用して融解温度Tmを計算します。 このソフトウェアは、設計されたアッセイの出版物品質レポートもエクスポートし、同僚と共有することができる。データはプロジェクト形式で整理され、配列情報と検索結果のローカルデータベースが維持される。 クロスホモロジーの回避 LAMP DesignerはBLAST検索結果を自動的に解釈します。