Dados de referência pesquisáveis Construídos para Integração Nexus
Nexus DB é um recurso inestimável e incluído em todas as subscrições do Nexus Copy Number.
Características e Benefícios
Armazene seus próprios dados
Como usuário Nexus, você pode usar o NexusDB para armazenar seus próprios dados, de forma privada. Os dados são protegidos fora do local usando a plataforma AWS da Amazon.
Dados de Referência
Consulta por gene ou região de interesse para encontrar rapidamente amostras e anotações clínicas, com a capacidade de comparar dados gerados por diferentes plataformas aCGH, SNP array, e NGS.
Dados de Referência no Nexus DB
Capacidade de compartilhar seus próprios dados facilmente com as pessoas que você escolher e colaborar em todo o mundo.
Dados disponíveis no Nexus DB
Genética Constitucional
AGRE - Intercâmbio de Pesquisa Genética do Autismo. Todos os dados disponíveis tanto no genoma HG18 como no HG19 são construídos.
ISCA/ICCG (dbVAR) - Base de dados de variações estruturais (SV) de variantes genómicas com anotações clínicas para uma vasta gama de doenças genéticas constitucionais.
Affymetrix CytoScan HD Reference Project - 375 amostras normais usadas para criar o arquivo de referência do CytoScan HD
Câncer
TCGA Premier - dados TCGA reprocessados e curados manualmente, resultando em um aumento dramático da fidelidade e correspondente redução nas chamadas falso-positivas.
Os conjuntos de dados incluem Leucemia Mielóide Aguda, Glioblastoma (GBM), Adenocarcinoma de Cisto Seroso do Ovário, Carcinoma de Células Renais Claras do Rim, Adenocarcinoma do Cólon, Carcinoma Escamoso do Pulmão, e muito mais.
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