Software hospitalar Nexus Copy Number™

de análisede visualizaçãoNGS

O software Nexus Copy Number permite que os investigadores analisem múltiplos tipos de dados -arrays, painéis NGS, WES/WGS, e coortes de investigação de dados de expressão - para uma visão de todo o genoma. Revelar novos conhecimentos com incrível simplicidade através de uma variedade de ferramentas avançadas de análise e visualização. Integrar dados fenotípicos e genómicos para desvendar correlações genéticas significativas. Associar um número ilimitado de anotações ou atributos de amostras para análises posteriores a jusante. Utilizar a ferramenta de poder preditivo para encontrar correlações entre atributos fenotípicos e alterações genómicas, realizar análises de sobrevivência para amostras de cancro (com gráficos Kaplan-Meir), ou estratificar amostras com base em perfis de aberração e fenótipos para identificar mutações do condutor. O Nexus Copy Number permite o agrupamento usando meios K ou agrupamento hierárquico com a capacidade de ajustar o número de agrupamentos. Identificar termos de ontologia genética (GO) enriquecidos em todo o genoma usando GSEA ou encontrar termos GO significativamente sobre-representados apenas em regiões seleccionadas. Utilizar a função de concordância para identificar alterações genómicas que co-ocorram com alterações do número de cópias, regiões LOH, ou pequenas mutações, e retratar estas relações num gráfico circular. Analisar e visualizar múltiplas amostras em paralelo - não é necessária perícia em bioinformática. Nexus Copy Number fornece funções estatísticas robustas e gráficos interactivos ricos, sem a necessidade de perícia em programação gráfica e estatística. É uma poderosa solução de desktop (Windows ou Mac OS) que permite a visualização e análise de dezenas de milhares de arrays de alta densidade em paralelo.