Este kit pode ser usado em dois modos. Ele pode ser usado para descoberta de isoformas ou para avaliar a transcrição adundance. Executá-lo no primeiro modo também fornecerá dados de abundância. Este kit fornece um levantamento abrangente e uma abundância relativa precisa de cada transcrição em amostras de RNA. Dados de leitura longa de uma molécula única são gerados, bem como a abundância relativa usando contagem molecular baseada em código de barras. Ele também apresenta um fluxo de trabalho multiplex que reúne 24 amostras em um único tubo com menos de 3 horas de tempo prático.
É o kit perfeito para laboratórios que procuram traçar o perfil de cada transcrição na sua amostra. Compatível com todos os instrumentos Illumina.*
*HiSeqs, NextSeqs, e NovaSeqs são recomendados para benefícios de custo por base.
Tempo de ensaio
8.5 horas
Hands-On Time
2.5 horas
Mecanismo de Acção
Sequenciação de leitura longa sintética
Multiplexação
Permite que 8 amostras sejam processadas em um tubo
Quantidade de entrada
10ng de RNA total
Categoria
Transcriptome
Compatibilidade do Sistema
HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq, NovaSeq, MiSeq, MiniSeq
Tipo de Ácido Núcleico
RNA
Método
2 x 150 Sequência Paired End (PE)
Tipos de amostras especializadas
Amostra eucariótica
Tecnologia
Montagem de uma leitura sintética longa em forma de leitura curta
Capacidade de automatização
Sim
As vantagens da sequência de leitura prolongada. A conveniência
da sua infra-estrutura de sequenciação existente
O sequenciamento da próxima geração (NGS) tem sido uma técnica incrivelmente poderosa, mas
são muitas aplicações onde a sequência de leitura curta surge, bem, curta.
Felizmente, a Loop Genomics desenvolveu uma solução acessível e fácil de implementar que utiliza as
Sequenciadores Illumina NGS para produzir sequências completas e de longa leitura.
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