Pipelines de análise de RNA-seq prontos a utilizar, alimentados por algoritmos QIAGEN CLC
Compatível com os kits de preparação de bibliotecas mais utilizados
Exploração fácil e intuitiva e filtragem de genes diferencialmente expressos num painel interativo de fácil utilização
Apoio à interpretação através da anotação com as vias mais afectadas, a montante
reguladores a montante, doenças e funções consultadas a partir da base de conhecimentos QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
Apoio à tomada de decisões em experiências de verificação de biomarcadores com o produto
recomendações de produtos e ferramentas de conceção personalizadas convenientes no QIAGEN GeneGlobe Design & Analysis Hub
Detalhes do produto
As soluções GeneGlobe Analyze combinam algoritmos e conhecimentos líderes da indústria com facilidade de utilização. O QIAGEN RNA-seq Analysis Portal, baseado na nuvem, é acessível a partir do GeneGlobe Analyze e permite a análise de dados de RNA-seq, desde o alinhamento de leituras brutas até à interpretação de genes diferencialmente expressos e à procura das ferramentas certas para a verificação de potenciais biomarcadores.
Desempenho
O QIAGEN RNA-seq Analysis Portal reduz o tempo de análise de dias para apenas algumas horas:
análise de microRNA: requer apenas 90 minutos desde o ficheiro fastq até à expressão diferencial (com base em dados do QIAseq miRNA Library Kit, 96 amostras com ~5M leituras por amostra, leituras de extremidade única de 75 pb)
Análise de todo o transcriptoma: requer apenas 4 horas desde o ficheiro fastq até à expressão diferencial (com base nos dados do QIAseq Stranded RNA Library Kit, 96 amostras, 60 milhões de leituras por amostra, leituras de extremidade emparelhada 2 x 75 pb)
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