研究用ソフトウェアモジュール SimpleSlideInterface

病理組織実験用バーチャル顕微鏡用病理学用マクロ撮像用

概要
SimpleSlideInterface は、デジタル病理スライド、注釈、メタデータへの構造化されたプログラムアクセスを提供する REST ライクな API およびソフトウェアインターフェースです。3DHISTECH のソリューション（SlideCenter、SlideStorageDX）やローカルリポジトリとサードパーティシステムを統合し、自動化画像解析、AI ワークフロー、高スループット研究、臨床でのマルチユーザー連携を可能にします。

機能

• 効率的なスライドアクセス：ローカルストレージ、SlideCenter、SlideStorageDX からスライドを取得、開封、検索。
• スライドメタデータ取得：寸法、解像度、チャネル、スキャンマップ等のプロパティ抽出。
• 高度なタイル／画像処理：座標、倍率、フォーカスインデックスに基づく特定タイルや領域の読み取り。
• 注釈管理：GeoJSON ベースの注釈の読み取り／挿入／削除。TMA マーカー対応。
• オリジナル FOV（視野）アクセス：カメラの生データ取得（ライセンス必要）。
• 検索・フィルタリング：ローカルおよびリモートリポジトリを横断したフォルダ／スライド検索。
• 開発者サポート：Python サンプルと Jupyter Notebook 統合による迅速なプロトタイピング向け REST ライク API。

主な特徴（概要）

• スライドアクセスと操作のための REST ライク API。
• Python サンプルおよび Jupyter Notebook サポート。
• 効率的なタイル取得と選択的領域読み取り。
• 研究および臨床導入向けの安全な統合オプション。

製品バリアントとライセンス

• SimpleSlideInterface (Research Version)：研究向けエディションで主要機能は無償利用可能。ローカルスループットに制限があり、ローカル無制限アクセスや高速タイル取得は有償ライセンスで提供。
• SimpleSlideInterface DX (Integration Version)：臨床・診断システム向けの統合エディションで、SlideStorageDX へのフルアクセスはライセンス提供。患者データの取得を行わない安全な画像アクセスを実現。
• 無料版の制限：同時実行は1インスタンス、ローカルスライドアクセスに制限、タイル取得は1000タイル/秒（64 MP/秒）に制限。

追加機能

• スライドを開いた際の画像および属性データのスライド単位キャッシュ。
• GeoJSON 注釈の読み書きサポートおよび TMA マーカー処理。

システム要件

• ハードウェア：AVX2 対応の 4 コア CPU（Intel Haswell または AMD Zen）、4 GB RAM、1.0 GB の空きディスク。
• OS：最低 Windows 10 Pro（64 ビット）または Windows Server 2019（64 ビット）。
• ネットワーク：最低 1 Gb/s、リモート保存時は最適な性能のため 10 Gb/s 推奨。
• パフォーマンス：CPU スレッドあたり約 8 スライドをサポート。開いたスライドあたり約 100 MB の RAM を使用。
• 追加ソフトウェア：Windows Server ホスティングの場合は Microsoft .NET 8.0、Microsoft Visual C++ 2015-2022 Redistributable (x64)。

注意事項
SlideCenter／SlideStorageDX と連携する場合、または別ホストで稼働させる場合は高帯域のネットワークが必要です。インターフェースはスライドを開いた際に画像および属性データをキャッシュするため、メモリ使用量に影響します。

技術仕様

• インターフェース種別：REST ライク API
• 主要統合：SlideCenter、SlideStorageDX、ローカルスライドリポジトリ
• 開発者サポート：Python サンプル、Jupyter Notebook サンプル
• 注釈フォーマット：GeoJSON（読み取り／挿入／削除）
• タイル取得上限（無料）：1000 タイル／秒（64 メガピクセル／秒）
• オリジナルカメラ FOV 取得：利用可能（ライセンス必要）
• スライド当たりのメモリ使用量：約 100 MB（開いた時）
• CPU 要件：AVX2 対応 4 コア；CPU スレッドあたり 8 スライドをサポート
• 最小 RAM：4 GB
• 最小ディスク：1.0 GB 空き
• 最小ネットワーク帯域：1 Gb/s（10 Gb/s 推奨）
• 必要ランタイム：Microsoft .NET 8.0（Windows Server ホスティング時）