Módulo de software para pesquisa SimpleSlideInterface

para laboratório de histopatologiapara microscopia virtualde imagens macroscópicas de patologia

Visão geral
SimpleSlideInterface é uma API do tipo REST e interface de software que fornece acesso programático e estruturado a lâminas de patologia digital, anotações e metadados. Integra as soluções 3DHISTECH (SlideCenter, SlideStorageDX) e repositórios locais com sistemas de terceiros para permitir análise de imagem automatizada, fluxos de trabalho de IA, pesquisa de alto rendimento e colaboração clínica multiusuário.

Capacidades

• Acesso eficiente às lâminas: recuperar, abrir e consultar lâminas do armazenamento local, SlideCenter e SlideStorageDX.
• Recuperação de metadados: extrair propriedades como dimensões, resolução, canais e mapas de varredura.
• Manipulação avançada de tiles e imagens: ler tiles ou regiões específicas com base em coordenadas, ampliação e índices de foco.
• Gestão de anotações: leitura/inserção/remoção de anotações em GeoJSON; suporta marcadores TMA.
• Acesso ao campo de visão original (FOV): recuperar dados brutos da câmera (licença requerida).
• Pesquisa e filtragem: buscas de pastas e lâminas em repositórios locais e remotos.
• Suporte a desenvolvedores: API tipo REST com exemplos em Python e integração Jupyter Notebook para prototipagem rápida.

Recursos principais (alto nível)

• API tipo REST para acesso e manipulação de lâminas.
• Exemplos em Python e suporte Jupyter Notebook.
• Recuperação eficiente de tiles e leitura seletiva de regiões.
• Opções de integração seguras para implantações de pesquisa e clínicas.

Variantes de produto e licenciamento

• SimpleSlideInterface (Research Version): edição orientada à pesquisa com acesso gratuito às funções principais; rendimento local limitado e upgrades licenciados para acesso local ilimitado e recuperação de tiles mais rápida.
• SimpleSlideInterface DX (Integration Version): edição de integração para sistemas clínicos/diagnósticos com acesso total licenciado ao SlideStorageDX e acesso seguro às imagens sem recuperação de dados de pacientes.
• Limitações da versão gratuita: instância única, acesso local restrito, recuperação de tiles limitada a 1000 tiles/s (64 MP/s).

Recursos adicionais

• Cache por lâmina de dados de imagem e atributos ao abrir.
• Suporte de leitura/escrita de anotações GeoJSON e manipulação de marcadores TMA.

Requisitos do sistema

• Hardware: CPU 4 núcleos com AVX2 (Intel Haswell ou AMD Zen), 4 GB RAM, 1,0 GB de disco livre.
• SO: Windows 10 Pro (64-bit) ou Windows Server 2019 (64-bit) mínimo.
• Rede: largura de banda mínima 1 Gb/s; 10 Gb/s recomendado para repositórios remotos de lâminas.
• Performance: suporta ~8 lâminas por thread de CPU; ~100 MB de RAM por lâmina aberta.
• Software: Microsoft .NET 8.0 (para hospedagem em Windows Server); Visual C++ 2015-2022 Redistributable (x64).

Observações
Alta largura de banda de rede é necessária ao integrar com SlideCenter/SlideStorageDX ou ao hospedar em uma máquina remota. A interface faz cache dos dados de imagem e atributos ao abrir uma lâmina, o que afeta o uso de memória.

Especificações técnicas

• Tipo de interface: API do tipo REST
• Integrações principais: SlideCenter, SlideStorageDX, repositórios locais de lâminas
• Suporte a desenvolvedores: exemplos Python, exemplos Jupyter Notebook
• Formato de anotação: GeoJSON (leitura/inserção/remoção)
• Limite recuperação de tiles (gratuito): 1000 tiles/s (64 Megapixels/s)
• Recuperação FOV da câmera original: disponível (licença requerida)
• Uso de memória por lâmina: ~100 MB ao abrir
• Requisitos de CPU: 4 núcleos com AVX2; suporta 8 lâminas por thread de CPU
• RAM mínima: 4 GB
• Disco mínimo: 1,0 GB livre
• Largura de banda mínima de rede: 1 Gb/s (10 Gb/s recomendado)
• Runtime requerido: Microsoft .NET 8.0 (para hospedagem em Windows Server)