NGSシーケンシングソフトウェアモジュール SEQNEXT
研究所用分析キャプチャー

NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
NGSシーケンシングソフトウェアモジュール
お気に入りに追加する
商品比較に追加する
 

特徴

応用
研究所用, NGSシーケンシング
機能
分析, キャプチャー, 製図用

詳細

SEQNEXTは、次世代シーケンサーデータのマッピング、アライメント、バリアント検出のためのパワフルでユーザーフレンドリーなアプリケーションです。SEQNEXTは、一般的なシーケンスプラットフォームやキット(PCRベース、エンリッチメント、シーケンスキャプチャー)のデータを解析することができます。検出されたすべてのバリアント(長さを問わない欠失、挿入、インデル、SNP、リピート領域、CNV、遺伝子融合など)をわかりやすく直感的に視覚化することができます。 SEQNEXTは、dbSNP、1000 Genomes、ClinVar、ExAC、gnomADといった公開SNPデータベースにアクセスし、分類やフィルタリングを行います。すべての結果データは、経験や知識を共有するためのバリアントデータベース(varSEAK)と交換することができ、ラボの内部LIMシステムに転送したり、パーソナライズされた患者レポートとして発行したりすることができます。 NEW SARS-CoV-2などのウイルスシークエンスデータの解析を改善しました。 トリオアナリシスと改良型プールアナリシス バリアントテーブルのSequence Ontology Annotationsについて varSEAKとdbSNP, ClinVar, UK10K, ESP, gnomAD, ExACのような利用可能なすべての外部DBへのジャンプオプション。 ホールエクソームシーケンス(WES)解析 すべての一般的な次世代シーケンスプラットフォームおよびキットのデータに対応しています。 hg19および/またはhg38に基づくベッドまたはマニフェストファイルのインポートにより、個々のターゲット領域(ROI)を簡単にセットアップ可能 WESデータのフィルタリングと解析のための遺伝子リストのインポート fastqファイル、fastq.gzファイル、bamファイルの解析 マッピング、アライメント、品質、バリアントコールの効率的な標準(使用アルゴリズム:BWA、Smith-Waterman、JSIで適応済み) 解析とバリアントコールのパーソナライズ設定(≥0.1 %)。 あらゆる長さの欠失、挿入、インデル、SNP、リピート領域、CNV、遺伝子融合などを高感度かつ特異的に検出可能

---

カタログ

SEQUENCE PILOT
SEQUENCE PILOT
2 ページ
*価格には税、配送費、関税また設置・作動のオプションに関する全ての追加費用は含まれておりません。表示価格は、国、原材料のレート、為替相場により変動することがあります。