HLAシーケンス用ソフトウェアモジュール SEQNEXT-HLA

研究所用分析製図用

SEQNEXT-HLAは、一般的な次世代シーケンスプラットフォームやキットから得られるHLA配列ベースのタイピングデータを解析するための、強力でユーザーフレンドリーなアプリケーションです。IMGT HLAデータベースの全バージョンをダウンロードおよびインポートすることが可能です。結果計算のために、イントロン配列はヌルアレルを除外するために考慮することができ、さらに、フェーシングをチェックすることができます。 カバーリングやバックグラウンドの警告を表示することができます。新しいアレルも呼び出すことができます。結果は、最大、1フィールド、2フィールドの解像度、およびNMPDコードで表示することができます。すべての結果データは、ラボの内部LIMシステムに転送され、またはパーソナライズされた患者レポートとして発行することができます。 すべての一般的な次世代シーケンスプラットフォームおよびキットのデータに対応しています。 IMGT HLAデータベースに基づき、個々のターゲット領域（ROI）を簡単に設定することができます。 fastq-またはfastq.gz-fileの解析。 マッピング、アライメント、クオリティ、アレルコーリングのための効率的な基準 アレルコールに関する設定を行うことが可能 完全な遺伝子座の解析（エクソンおよびイントロンのデータ） イントロン配列に基づくヌル対立遺伝子の検出・排除 曖昧さをなくすためのフェージングチェック 新しい対立遺伝子の検出