シークエンシング用ソフト
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... 配列に基づく微生物同定サービスに加え、配列に基づく菌株タイピング法である単座・多座配列タイピング(SLSTまたはMLST)による菌株タイピングも行っています。生産施設が微生物汚染を経験した場合、その発生源を特定することが優先されます。AccuGENX-ST®株タイピングは、生産施設における微生物汚染の調査において、微生物学者を支援します。 AccuGENX-ST®は、SLSTおよびMLST(単座・多座シーケンスタイピング)という確立された高精度なシーケンス法を用いて、同じ種のメンバーを株レベルで区別する微生物特性評価プロセスです。 微生物同定のための標準領域(16S、D2、ITS2)以外のDNA配列を決定し、菌株レベルでの差異や類似性を証明するデータを提供します。SLSTおよびMLSTを用いた菌株レベルでの判定により、汚染源を明確に追跡したり、既知の生産菌株を単純に検証することができます。 SLSTおよびMLSTシーケンスベースの株タイピングの再現性が高いことから、プロバイオティクス菌株が同じかどうか、ある地域から回収された分離株が別の分離株と同じか異なるかを判定することができます。これは、フラグメントベース解析を利用する方法と比較して、高い分解能と長期にわたる追跡および傾向分析プロジェクトにおける高い信頼性を実現する重要な特性となっています。 ...
... Partek® Flow® は、次世代シーケンサーデータアプリケーション用のスタートからフィニッシュまでのソフトウェア解析ソリューションです。使いやすいインターフェース、堅牢な統計アルゴリズム、情報量の多い可視化、最先端のゲノムツールを備えており、あらゆるレベルの研究者が自信を持ってデータ解析を行うことができます。 生データファイルから意味のある結果まで、1つのソリューションで迅速に処理するために必要なすべてのツール 生データ、アラインメントされたリード、カウントデータ、正規化されたカウントなど、自分にとって意味のあるパイプラインを入力することができます。 カスタマイズ可能なインタラクティブな可視化により、データを探索することができます。 生物学者 コマンドラインを使うのが苦手ですか?Partek ...
... GenomSys Variant Analyzerは、MPEG-Gゲノムデータフォーマットにネイティブに対応し、正確なバリアントの同定、アノテーション、解釈(SNV、インデル、CNV)を可能にするCEマーク取得済みのプラットフォームです。GenomSys Variant Analyzerは、最先端のパイプラインとMPEG-G特有の機能を活用し、診断プロセスや治療法の選択において専門家をサポートします。 GenomSys Variant Analyzerの主な利点は以下の通りです。 - ...
GenomSys
... GenomSys MPEG-G Codec Suiteは、ISO/IEC-23092のゲノムデータ規格(MPEG-G)に準拠したゲノムデータを処理するソフトウェアツール集です。GenomSys MPEG-G Codec Suiteは、98/79/CE指令に基づく体外診断用医療機器としてCEマークを取得しており、臨床診断を目的とした使用が認められています。 このツールにより、企業はこの規格を導入し、その利点を活用することができます。独自のMPEG-G規格の主な利点は以下の通りです。 - ...
GenomSys
... NextGENeLR Softwareは、Pacific Biosciences RS、RSII、Sequel、Sequel IIシステム、Oxford Nanopore MinIONなどのロングリードシーケンスデータを解析するための効果的で使いやすいリソースです。 NextGENeLRは、低頻度SNVおよびインデルの検出、構造変異検出、ミトコンドリアハプロタイピングを含む全ゲノムミトコンドリアDNA解析に使用でき、混合サンプルもサポートします。解析は直感的なインターフェースでセットアップでき、多数のサンプルのバッチ処理も容易です。PACBIO®やOxford ...
... キュレーションされたCNV、シーケンスバリエーション、アクセスの簡素化。 がんゲノムアトラス(TCGA)は、30種類以上のがんタイプで12,000腫瘍に近づくゲノムプロファイルを含むように成長している驚くべき資源です。 データを再分析し、訓練を受けた科学者によって各サンプルの結果を手動でキュレーションすることにより、TCGA Premierデータベースは、この豊富なリソースから最も忠実度の高いコピー番号情報を提供します。 専門家によってキュレーションされた機能と利点 特別なアクセスを通じて入手可能な生データから始めて、我々は、生殖細胞多型を除去するために、それらの適合した正常と腫瘍をペアリングしています。 ...
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