Os painéis Swift Amplicon HS permitem a detecção de variantes de frequência ultra baixa com e abaixo de 1% MAF de 10-20 ng de ADN livre de células (cfDNA) para sequenciadores Illumina®. Os erros de nucleotídeos, normalmente introduzidos durante a PCR e o sequenciamento, são removidos através da implementação de identificadores moleculares únicos (MIDs ou UMIs) que marcam de forma única os modelos alvo durante a amplificação.
Destaques
- Sensível e específico Detecta robustamente SNVs e indels até 0,25% de frequência de alelos
- Compatível com cfDNA e FFPE, amplifica de 10-50 ng de cfDNA
- Fluxo de trabalho rápido, dados de alta qualidade De DNA a bibliotecas compatíveis com Illumina® dentro de 3 horas
- Ferramentas de análise de dados emparelhados - com base em alto nível ou código aberto
Os painéis Swift Amplicon HS permitem a chamada de variantes com frequência inferior a 1%, com sensibilidade do alelo dependente da quantidade de material de entrada disponível e da profundidade do sequenciamento. Utilizando 10 ng de ADN de entrada, este ensaio detecta consistentemente variantes a 0,5% com uma profundidade de sequenciação recomendada de pelo menos 60.000x (1M leituras) antes da deduplicação com MIDs e 0,25% a partir de 20 ng de ADN de entrada.
Os Painéis Swift Amplicon HS facilitam a chamada de variantes específicas de mutações clinicamente relevantes em e abaixo de 1%
frequência. A tecnologia permite isto através da incorporação de identificadores moleculares (MIDs ou UMIs), que
melhorar a sensibilidade e especificidade através da remoção de erros falsos positivos introduzidos durante a PCR e o sequenciamento.
Aplicações Suportadas
- Oncologia - biopsia líquida cfDNA e tecido FFPE
- Detecção do Genoma/Hospedeiro - Doença do Enxerto vs. Hospedeiro e Fetal no cfDNA* Materno
- Metas personalizadas*
Especificações
ADN de entrada necessário e limite de detecção 10 ng para detecção de 0,5%; 20 ng para detecção de 0,25%
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