Kit de reagentes em solução KAPA HyperPETE

para pesquisapara DNA

O fluxo de trabalho KAPA HyperPETE é uma nova tecnologia de captura híbrida concebida para utilizar reações de extensão de primers com o objetivo de capturar e libertar especificamente moléculas da biblioteca-alvo para sequenciação. Os painéis do catálogo KAPA HyperPETE incluem painéis de design fixo prontamente disponíveis para variantes pan-oncológicas (com um módulo MSI), pontos-chave oncológicos, oncologia hereditária, variantes de fusão no cancro do pulmão e rastreio neonatal. Estes painéis de design fixo beneficiam de mais de uma década de experiência na conceção de sondas. Vantagens em resumo Desenvolvido para revelar informação genómica crítica a partir de tipos de amostras difíceis ARN tecidual (FFPET) Alcança um enriquecimento altamente específico a partir de uma ampla gama de quantidades de ARN FFPET de entrada (Figura 1) Deteta todas as fusões presentes em amostras de linhas celulares de referência (Tabela 1) cfDNA plasmático Alcança uma elevada percentagem de leituras no alvo e elevada cobertura de exões (≥1000X) para uma variedade de quantidades de cfDNA de entrada (Figura 2) Deteta variantes com elevada sensibilidade, a partir de uma variedade de quantidades de cfDNA plasmático de entrada Desempenho utilizando ARN FFPE com o Painel de Fusões KAPA HyperPETE LC. O Painel de Fusões KAPA HyperPETE para Cancro do Pulmão alcançou 92% a 97% de leituras no alvo a partir de 10 ng e 50 ng de todas as amostras de FFPE testadas. A elevada especificidade foi demonstrada pela elevada percentagem de leituras no alvo, partindo de 10 ng ou 50 ng de RNA FFPE de entrada com diferentes níveis de qualidade (baixa, média, elevada). A taxa de leituras no alvo situou-se entre 92% e 97% (incluindo alvos de referência e de fusão), com bom desempenho em todas as quantidades, qualidades e tipos de amostras de entrada. A taxa de leituras no alvo foi calculada após a remoção das leituras de rRNA (0,8% a 11% do total de leituras). Foram utilizadas duas (2) amostras de linhas celulares (em duplicado) e catorze (14) amostras FFPET adjacentes normais para avaliar o desempenho.