Aumente a precisão e o rendimento com os adaptadores e acessórios KAPA
No sequenciamento de última geração (NGS), a utilização de adaptadores indexados para a identificação das amostras aumenta consideravelmente a eficiência. Este processo, conhecido como multiplexação, permite agrupar várias amostras numa única sessão de sequenciamento, sendo as leituras resultantes posteriormente classificadas por meio de bioinformática.
No entanto, alguns sequenciadores de alto rendimento são propensos a erros de atribuição de índices (index hopping), o que pode reduzir a qualidade dos dados. As estratégias de indexação dupla única (UDI) ajudam a mitigar o impacto destes eventos.
A Roche oferece dois tipos de adaptadores KAPA:
Adaptadores de comprimento total: Para preparação de amostras sem PCR com até 96 combinações de índices
Adaptadores KAPA UDI
Vantagens em resumo
Baixas taxas de atribuição incorreta aumentam a confiança nos resultados
A atribuição incorreta de índices durante o sequenciamento multiplexado pode resultar de vários fatores, incluindo:
Salto de índice
Contaminação cruzada de códigos de barras ou amostras
Troca de molde durante a amplificação por PCR de amostras agrupadas
Erros de sequenciamento ou análise
Algumas destas questões podem ser mitigadas através de um design cuidadoso dos adaptadores e do controlo de qualidade.
Os adaptadores KAPA UDI foram concebidos para garantir resultados fiáveis através de:
Combinações únicas de índice duplo que permitem filtrar as leituras com combinações inesperadas de códigos de barras antes da análise dos dados
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