磁気ボール式試薬キット SMARTer®

単細胞リボ核酸配列用プロテイン

SMARTer Target RNA Capture for Illuminaは、エンリッチされたトータルRNAからcDNAを生成するために設計された完全なシステムです。ターゲットRNA-seqは、全トランスクリプトーム増幅（WTA）RNA-seq実験に固有のいくつかの課題を克服し、シーケンスカバレッジと、低量で存在する可能性がある目的の転写物の検出感度を向上させることができます。また、ターゲットRNA-seqアプローチは、コスト削減と解析の簡素化という点でも有利に働きます。cDNA合成の前に目的の転写物を濃縮することで、キメラ遺伝子融合、転写物アイソフォーム、スプライスバリアントなど、他の方法では見逃されるか、検出するためにはるかに多くのシーケンスリードを必要とする転写物に関する情報を取得することができます。感度が向上することで、S/N比が低下し、解析力が向上します。 SMARTer Target RNA Capture for Illuminaは、エンリッチされたRNA転写物からcDNAを生成するために使用されます。ユーザーが設計したターゲット特異的なビオチン化DNAプローブを目的の転写産物にハイブリダイズさせ、得られたRNA-DNAハイブリッドをCapture Beadsで捕捉します。本キットは、SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencingの感度を利用して、これらのエンリッチされた転写物から高品質の完全長cDNAを生成します。このキットは10 ngのトータルRNAでテストされ、わずか100 pgの精製トータルRNA由来の濃縮転写物からcDNA合成を行うことが示されています。このキットで生成したcDNAライブラリーは、Illuminaシーケンスプラットフォームとの互換性がテストされています。この方法は、追加のrRNA除去方法やキットを必要としません。