Swift Amplicon HSパネルは、イルミナ® シーケンサー用の無細胞DNA(cfDNA)の10-20ngから 1% 以下の超低周波変異体検出を可能にします。 通常、PCRおよびシーケンシング中に発生するヌクレオチド誤差は、増幅時に標的テンプレートを一意にラベル付けする一意の分子識別子(MIDまたはUMI)の実装によって除去されます。
ハイライト
• 敏感
で特異的なSNVを堅牢に検出し、0.25% の対立遺伝子周波数までインデル • cfDNAおよびFFPEと互換性があり、10-50 ngのcfDNAから
高速ワークフロー、高品質データ 3時間以内にDNAからIllumina® 互換ライブラリまで
• ペアリングされたデータ分析ツール-クラウド-ベースまたはオープンソースの
Swift Amplicon HSパネルは、1%以下の周波数でバリアントの呼び出しを可能にします。アレル感度は、利用可能な入力材料の量とシーケンシングの深さに依存します。 このアッセイは、10ngの入力DNAを使用して、MIDによる重複排除の前に少なくとも60,000x(1M読み取り)、20ngの入力DNAから0.25%の推奨シークエンシング深さで、0.5%の変異体を一貫して検出します。
Swift Amplicon HSパネルは、1%以下の
頻度で臨床的に関連する突然変異の標的型呼び出しを容易にする。 この技術は、分子識別子(MIDまたはUMI)を組み込むことでこれを実現し、
PCRおよびシーケンシング中に生じた誤検出エラーを除去することで感度と特異性を向上させます。
サポートされているアプリケーション
• 腫瘍学 — 液体生検cfDNAおよびFFPE組織
• ゲノム/宿主検出 — 母体cfDNAにおける移植片対宿主疾患および胎児*
• カスタムターゲット*
仕様
入力DNAおよび検出限界値 0.5% 検出では10 ng、0.25% 検出では20 ng
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