サンプル準備用試薬キット KAPA RNA EvoPrep
DNAポリメラーゼDNAリガーゼ研究用

サンプル準備用試薬キット - KAPA RNA EvoPrep  - Roche Sequencing Solutions - DNAポリメラーゼ / DNAリガーゼ / 研究用
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特徴

応用
DNAポリメラーゼ, DNAリガーゼ
用途
研究用, サンプル準備用, 次世代シーケンシング用

詳細

概要
KAPA RNA EvoPrep キットは、次世代シーケンス(NGS)向けのRNAライブラリ調製の簡素化されたワークフローを提供します。KAPA RNA HyperPrep Kit の系譜を受け継ぎ、EvoPrep キットは入力 RNA をアダプターが付加されたライブラリに変換し、工程数を減らしてハンズオン時間を短縮します。本製品は研究目的専用(RUO)であり、診断目的には使用できません。

KAPA RNA EvoPrep キット(RNAライブラリ調製用)
  • 約3.5時間の迅速ワークフロー、ハンズオン時間は最小限
  • 高感度:低入力や劣化した(FFPE)RNAからもより多くのユニークトランスクリプトを検出
  • 信頼性:入力量にわたる高い一致性と再現性のある結果

主な利点とハイライト
  • ワークフローの簡素化により、ハンズオン時間、試薬およびプラスチック消耗を削減
  • 広い入力範囲で改善されたライブラリ変換率と高い収量
  • ユニーク分子の検出増加(マップされたユニーク率の向上、重複率の低下、アダプターダイマー率の低下)
  • 自動化対応:液体ハンドリング自動化およびRoche AVENIO Edge System のワークフローに対応
  • 改良されたライゲーション化学(KAPA EvoT4 DNA ligase)および増幅ミックス内の KAPA HiFi HotStart DNA Polymerase を含み、低バイアスで高忠実度のPCRを実現

性能と感度
本キットは従来の KAPA RNA HyperPrep Kits や競合キットと比較して性能が向上しており、低品質のFFPET入力や低入力(5 ng)から高入力(キット推奨上限まで)においてより多くの遺伝子およびトランスクリプトを検出します。報告データは、低品質FFPETサンプルでの検出遺伝子数の増加、マップされたユニーク率の向上、重複率の低下、アダプターダイマー率の低下を示しています。

ワークフロー概要
  • 前処理の選択:mRNAキャプチャ(poly(A) オリゴ-dT ビーズ)または rRNA および/または グロビン除去(相補的 DNA オリゴとのハイブリダイゼーション後に RNase H/DNase 処理)
  • RNA の断片化(加熱+マグネシウム)
  • ランダムプライミングによる第1鎖cDNA合成
  • 第2鎖合成と A-tailing の同時処理(第2鎖に dUTP を導入してストランド特異性を確保)
  • アダプターライゲーション(A-tailed フラグメントへの TA-ligation)
  • 高忠実度ポリメラーゼを用いたライブラリ増幅(dUTPでマーキングされた鎖は増幅されず、ストランド特異性を維持)

互換性と推奨入力量
表(製品バリアントと典型的入力量):
Product variant — Typical reactions — EAN
KAPA RNA EvoPrep (24rxn) — 24 reactions — 07613336240564
KAPA RNA EvoPrep (96rxn) — 96 reactions — 07613336240557
KAPA RNA EvoPrep Kit (384rxn) — 384 reactions — 07613336239308
KAPA mRNA EvoPrep (24rxn) — 24 reactions — 07613336239377
KAPA mRNA EvoPrep (96rxn) — 96 reactions — 07613336239384
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (24rxn) — 24 reactions — 07613336239315
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (96rxn) — 96 reactions — 07613336239322
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (384rxn) — 384 reactions — 07613336239339
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase Globin (96rxn) — 96 reactions — 07613336239353
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase Globin (384rxn) — 384 reactions — 07613336239360

入力およびサンプル種に関する注記:推奨入力範囲はキットのバリアントにより異なります(例:一部の RNA EvoPrep キットでは 0.25 ng–100 ng、他では 5 ng–1 µg または 25 ng–1 µg 等)。KAPA mRNA EvoPrep は高品質 RNA(RIN ≥ 7)および poly(A) 選択ワークフローを想定しています。RiboErase (HMR) / Globin 搭載キットはヒト/マウス/ラットの除去を目的としており、適切な入力量とプロトコル調整を行えば低品質のFFPE RNA にも対応します。

保管および取扱い
一般的な保管指示:温度に敏感な成分(cDNA 合成およびライブラリ調製試薬)は –15°C~–25°C で保管してください。一部の前処理成分(例:mRNA キャプチャ)は 2°C~8°C、KAPA HyperPure Beads は 2°C~8°C で保管します。正確な保管・取扱い方法およびプロトコル内の推奨安全停止点については使用説明書に従ってください。

規制 / 使用上の注意
研究目的専用。診断目的での使用はできません。

仕様 / 技術情報
  • 製品ファミリー:KAPA RNA EvoPrep
  • 主な用途:NGS用RNAライブラリ調製(全転写物、遺伝子発現、スプライスジャンクション、遺伝子融合、lncRNA)
  • エンリッチメントオプション:無処理(全RNA)、mRNAキャプチャ(poly(A))、rRNA および/または グロビン除去(HMR/Globin)
  • 入力範囲(キット別の例):0.25 ng–100 ng;5 ng–1 µg;25 ng–1 µg(特定のキットに依存)
  • ライブラリ調製時間(典型):約 3.5 時間(簡素化プロトコル)
  • 断片化:加熱+マグネシウム、入力品質に合わせて調整可能
  • ストランド特異性:あり(第2鎖への dUTP 取り込みによりストランド特異性を実現)
  • ライゲーション化学:KAPA EvoT4 DNA ligase
  • 増幅ポリメラーゼ:KAPA HiFi HotStart DNA Polymerase
  • ビーズ精製:精製工程用に KAPA HyperPure Beads を供給
  • 自動化:液体ハンドリング自動化および Roche AVENIO Edge System と互換
  • 種の互換性:KAPA RNA EvoPrep(前処理なし)— 幅広い(真核生物、微生物、植物等);RiboErase (HMR)/Globin 搭載キット — ヒト、マウス、ラット用の除去オリゴ
  • 代表的な利点:感度向上(より多くのユニークトランスクリプト)、マップされたユニーク率の向上、複製率・アダプターダイマー率の低下、試薬・精製工程の削減

カタログ

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