KAPAのアダプターとアクセサリーで精度とスループットを向上
次世代シーケンシング(NGS)において、インデックス付きアダプターを使用してサンプルにバーコードを付与することで、効率が大幅に向上します。この「マルチプレクシング」と呼ばれるプロセスにより、1回のシーケンシング実行で多数のサンプルをプールすることが可能となり、得られたリードはその後、バイオインフォマティクスによって分類されます。
しかし、一部の高スループットシーケンサーでは、インデックスの誤割り当て(インデックスホッピング)が発生しやすく、データの品質が低下する可能性があります。ユニーク・デュアル・インデクシング(UDI)戦略は、こうした事象の影響を軽減するのに役立ちます。
ロシュは、2種類のKAPAアダプターを提供しています:
フルレングスアダプター:最大96種類のインデックス組み合わせに対応した、PCRフリーのサンプル調製用
KAPA UDIアダプター
メリットの概要
誤割り当て率が低いため、結果に対する信頼性が高まります
マルチプレックスシーケンシングにおけるインデックスの誤割り当ては、以下のような要因によって生じることがあります:
インデックスホッピング
バーコードまたはサンプルの交差汚染
プールサンプルのPCR増幅中のテンプレートスイッチング
シーケンシングまたは解析のエラー
これらの問題の一部は、慎重なアダプターの設計と品質管理によって軽減することができます。
KAPA UDIアダプターは、以下の機能を通じて信頼性の高い結果をサポートするように設計されています:
独自のデュアルインデックス組み合わせにより、データ解析前に予期しないバーコードの組み合わせを持つリードをフィルタリングして除外可能
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