NGS試薬 KAPA

溶液試薬媒体交配

概要
Roche の KAPA HyperCap および KAPA HyperPETE ワークフローによる効率的な NGS ターゲットエンリッチメント。広範から集中的なパネルまで対応し、カスタムデザインや低入力サンプル（cfDNA 等）に対応します。

ソリューション
2 種類の補完的技術を揃えた包括的なポートフォリオ。KAPA HyperCap ワークフローはハイブリッドキャプチャ方式で、大規模パネルや広範なバリアント検出に適します。KAPA HyperPETE ワークフローはプライマー伸長型ターゲットエンリッチメント（PETE）を採用し、小型の集中的パネルや超低入力（例：cfDNA）向けに設計されています。KAPA HyperPETE はアンプリコン様の迅速かつ簡便なワークフローと、ハイブリッドキャプチャに匹敵する均一性やオンターゲット率を両立します。

統合提供
高品質プローブ／プライマーと KAPA Library Prep Kits による統合ワークフローで、ターゲットシーケンシングプロジェクトのサンプル→ライブラリ工程を支援します。

• Exome probes：データベースカバレッジを重視した全エクソームソリューション
• Catalog panels：在庫から供給可能な固定設計の遺伝子パネル（迅速導入向け）
• Design Share panels：研究者と共同開発した専門的デザインのパネル
• Custom probes：ヒト／非ヒトを問わない任意領域のカスタム設計

主な製品タイプとハイライト
代表的な製品例と簡潔な説明：

• KAPA HyperExome V2 Probes and Kits：幅広いカバレッジを提供する全エクソームソリューション
• AVENIO Edge System：ライブラリ調製、ターゲットエンリッチメント、定量、正規化、プーリングを自動化する IVD ライクハンドラ
• KAPA EvoPlus Boost Kits：酵素断片化を用いた高性能 DNA ライブラリ調製、効率的な自動化対応ワークフロー
• KAPA HyperCap Catalog Panels and Kits：ターゲットエンリッチメント研究向けの遺伝子パネル
• KAPA HyperPETE Catalog Panels and Kits：KAPA HyperPETE ハイブリッドキャプチャ技術を用いた固定デザインパネル
• Design Share Panels：Roche の研究者と共同開発した NGS デザイン
• HyperDesign：KAPA ターゲットエンリッチメント技術と Roche のプローブ／プライマー設計ノウハウを組み合わせたカスタム設計ツール
• KAPA HyperCap Custom Probes / KAPA HyperPETE Custom Probes：DNA／RNA 領域向けのカスタムプローブ／パネル

価値
ターゲットエンリッチメントはシーケンシングリードを選択領域に集中させ、全ゲノムアプローチと比べてコストや計算負荷を低減します。これによりターゲット深度が向上し、異質性のある低入力サンプルにおける低頻度の体細胞変異検出感度が改善され、オンコロジー研究で重要な利点を提供します。

ビジョン
Roche はカタログ／既製パネルから完全カスタムデザインまで、NGS ターゲットエンリッチメントの包括的ソリューションを提供し、低入力や困難なターゲットから高精度かつ高感度な結果を導きます。

比較 / 考慮点（要約）
サイト上の詳細比較表では、KAPA HyperCap、KAPA HyperPETE、アンプリコン系ワークフローを使用性、性能、技術、所要時間、パネルサイズ、用途、二次解析サポートの観点で比較しています。主要な技術的要点は以下に要約されています。

注意
該当する場合、製品およびキットは研究用途（RUO）向けです。

技術仕様

• Workflows：KAPA HyperCap Workflow（ハイブリダイゼーションベースのキャプチャ）；KAPA HyperPETE Workflow（Primer Extension Target Enrichment）；アンプリコン系ワークフロー（PCR 増幅）
• 使用の容易さ：KAPA HyperCap – 自動化に適しハンズオン時間を短縮；KAPA HyperPETE – 1 日ワークフローで自動化可能；アンプリコン – 最も迅速なワークフロー
• 性能：KAPA HyperCap – 高いシーケンシング効率と主要な変異クラスの検出；KAPA HyperPETE – 小型パネルで最高の効率と主要変異クラスの検出；アンプリコン – 良好な SNV/Indel 性能、均一性は低く CNV/新規融合の検出は限定的
• ターンアラウンド：KAPA HyperCap – 約 1.5 日；KAPA HyperPETE – 1 日；アンプリコン – 1 シフト
• パネルサイズ：KAPA HyperCap – 全エクソーム相当までおよびそれ以上；KAPA HyperPETE – 最大約 250 Kb；アンプリコン – 数メガベースまで（実務上の制限あり）
• 用途：KAPA HyperCap – 遺伝性疾患研究および遺伝性/体細胞腫瘍研究；KAPA HyperPETE – 体細胞腫瘍研究および RNA 融合検出（既知・新規パートナー）；アンプリコン – 体細胞腫瘍研究および遺伝性疾患（既知融合）
• 二次解析サポート：KAPA HyperCap & KAPA HyperPETE – オープンソースのバイオインフォマティクスツールによる germline/ somatic 二次解析をサポート；アンプリコン – ベンダーに依存